進口報關代理公司過境是指允許海關根據相關法律法規，從關稅區內的一個海關地點到另一個海關地點辦理進出口海關手續，以加快港口進出口貨物的運輸，并便利發貨人和發貨人辦理海關手續的行為。
移交給海關的貨物的通關程序如下:
(1)進口貨物的收貨人或其代理人應在運輸工具入境申報之日起14天內向入境地海關申報轉運。
(2)進口貨物的收貨人或代理人申報轉船貨物時，應填寫《中華人民共和國海關轉船貨物報關單》(以下簡稱報關單)，并提交數據輸入中心進入海關計算機申報自動化系統，打印成正式報關單一式三份。
(3)進口貨物收貨人或者其代理人應當如實向海關申報，并提交報關單、裝運地海關出具的轉船進口貨物聯系單，以及相關的批準文件、運輸和商業文件(如提單或者運單、發票、裝箱單等)的商品。
(4)進口貨物的收貨人或者代理人申請進口許可證申請的過境貨物時，收貨人或者代理人應當提前向目的地海關提交進口許可證，經審查后，目的地海關應當出具進口過境貨物聯系單，并在入境地海關蓋章。
(5)進口貨物收貨人或者進口報關代理人提交的有關文件收到后，入境地海關應當查驗。批準后，相關文件應當密封并交給進口貨物的收貨人或其代理人。
(6)進口貨物的收貨人或者其代理人應當負責按照海關指定的路線，在規定的期限內將進口貨物運輸到目的地海關，并將目的地海關出具的海關印章提交目的地海關，并自貨物運輸到目的地海關之日起14日內，向目的地海關辦理報關納稅手續。
(7)是指裝運地海關在辦理移交海關的貨物進口手續后，按規定將收據退回進口地海關，以示對移交海關的貨物的監管結束。
(8)通過海關運輸的貨物裝載入境車輛進出香港和澳門，車輛司機應向入境地海關提交一式三份清單，并附有相關貨運和商業文件。經審查，入境地海關應當制作海關印章，交給入境地海關，由申請人接管。出境地海關負責辦理車輛和貨物的監管手續。
(9)保稅倉庫之間的貨物轉移程序，除了正常的貨物進出保稅倉庫程序外，還應符合上述(1) - (7)的程序。然而，在填寫報關單時，貨物將存放到的保稅倉庫的名稱應填寫在標明裝運地點的欄中。
進口代理出口轉關運輸貨物
(1)出口貨物的發貨人或其進口代理人應向出發地海關申報過境貨物的出口。
(2)出口貨物發貨人或其進口代理人應填寫《中華人民共和國出口過境貨物報關單》(以下簡稱《過境報關單》)和《中華人民共和國出口貨物報關單》(以下簡稱《出口報關單》)，將裝運地點的數據輸入海關計算機報關自動化系統，并打印正式過境報關單和出口貨物報關單一式三份。
(3)出口貨物的發貨人或者其進口代理人應當憑過境報關單、出口貨物報關單和隨附的相關貨運、商務文件，到出發地海關辦理報關納稅手續。
(4)啟運地海關在辦理出口貨物報關納稅手續后，簽發出口過境貨物聯系單，并將上述相關文件加蓋海關印章，提交申請人移交地海關。
(5)出口地海關應在貨物出口后按規定將收據退回出口地海關，以顯示對移交給海關的貨物的監管結束。
港澳臺出境車輛裝載的出口轉運貨物，車輛駕駛人應當向啟運地海關提交出口貨物報關單或者貨物清單一式三份，以及相關的貨運和商務文件。經審查，啟運地海關應當制作海關印章，并移交給申請人退運地海關，啟運地海關應當負責辦理車輛及其所載貨物的監管手續。
